Djelatnost Zavoda sastoji se od:
- obrade i liječenja endokrinoloških bolesti i dijabetoloških bolesnika od novorođenačke dobi do adolescencije te procjene dijabetičkih komplikacija
- funkcijskih endokrinoloških testiranja
- savjetovanja i edukacije djece oboljele od šećerne bolesti i njihovih roditelja (edukacija o prehrani, inzulinske pumpe)
- obrade i liječenja djece s akutnim i kroničnim bolestima respiratornog sustava te djece s alergijskim bolestima
- liječenja djece s urođenim i stečenim bolestima srca, reumatsko-imunološkim bolestima, te ostalim upalnim bolestima vezivnog tkiva
- dijagnostike i liječenja koje se obavlja kroz stacionar, laboratorij za bronhoskopiju i pH-metriju, alergološki laboratorij, laboratorij za funkcionalnu dijagnostiku pluća, laboratorij za funkcionalnu dijagnostiku srca (EKG, ergometrija, holter EKG,) te laboratorij za ultrazvučnu dijagnostiku srca, pluća te muskuloskeleta
- dijagnostičkih i terapijskih punkcija pleuralne šupljine i zglobova
- primjene svih metoda liječenja neinvazivnom mehaničkom ventilacijom
- edukacije djece i roditelja
- ispitivanja preosjetljivosti na lijekove
- primjena biološke i druge terapije